每个企业都有自身独特的成长路径与阶段，同时所有企业又都会遵循某些相同的内在发展规律。所以组织诊断与设计既要基于企业发展的共性，又要照顾到自身的个性。

另一个重要的指导思想是用系统论取代还原论，将企业视为一个有机整体，组织发展需要在各个子系统将达成协同与平衡，这些子系统包括业务战略、组织文化、业务流程、组织结构、知识与信息系统、目标与绩效、人才能力、领导力等。组织诊断首先对企业当前的发展阶段，核心战略与组织能力达成共识。进而基于此共识来诊断组织中各个要素（子系统）对业务战略达成所构成的支持或是障碍。

以组织结构设计为例：

组织结构的选择也是一个取舍的过程，任何结构都有其利弊。最适合的结构就是当下最能支持关键业务流程实施从而达成战略目标。组织结构的确立帮助厘清了价值链中各个单元扮演的角色，谁决策，谁支持，谁执行，并依此分配部门与层级的汇报关系与职责，进而制定相应的绩效考核指标。

具体实施步骤如下：

1. 业务分析：看行业、看客户、看对手，清晰的战略规划

2. 组织设计：架构草图、部门职责、人才结构

3. 岗位设置：岗位职责、胜任力模型、考核指标

4. 核心岗位盘点：沟通并达成共识、输出结果（提拔、培养、替换、招聘）

5. 运营机制：流程梳理、责权关系、信息协同、激励机制等